分析流程

真核生物有参考基因组的转录组分析流程

基于已知的基因组序列和注释信息,以NGS转录组测序数据作为输入,根据测序数据与参考基因组的序列比对情况,识别新的基因、新的可变剪接事件,并对新旧基因进行结构分析、表达定量和差异表达分析。
主要的分析内容:测序数据质量评估;测序数据与所选参考基因组的序列比对; 分析基因可变剪接情况;发掘未注释的基因区和新的转录本;识别转录区的SNP位点;定量基因和转录本表达水平,识别不同样品(组)之间显著差异表达的基因并对其进行功能注释和富集分析。

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